La mayoría de las ventanas de Presto muestran sus datos ordenados por un determinado criterio, por ejemplo, la ventana "Conceptos" ordena sus elementos por el contenido de la columna "Código" y la ventana "Facturas" lo hace por "Fecha", "Entidad" o "Documento" dependiendo de la opción seleccionada en la lista desplegable que hay a tal efecto.
Por otro lado, la ventana "Presupuesto" se puede ordenar según el contenido de una de sus columnas empleando las opciones de ordenación ascendente o descendente que aparecen en el menú contextual de algunas de sus columnas.
También se puede ordenar seleccionando el concepto y arrastrándolo a la nueva posición de una descomposición o mediante los iconos "Subir" y "Bajar" de las ventanas "Árbol" y "Presupuesto".